Análisis filogenéticos

  • Inicialmente se realizará un análisis filogenético en base al alineamiento “All-versus-all” en bulk de una centena de genes con poder predictivo a nivel de aminoácidos de todos los genomas de plantas disponibles mediante MUSCLE y un procesamiento por maximun likelihood en RaxML y/o máxima parsimonia con PAUP 4.0, todos ellos incorporados en el paquete CIPRES.
  • Para la búsqueda de ortólogos se utilizará inicialmente OrthoMCL y se complementará con COG
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